12-The Endgame

　ADAMによって超人的な力を得たFontaineとの対決で、純粋な戦闘のみのステージ。
エレベーターを降りると、ADAMを注入する台座に縛られている彼が見えるので、近づいてADAM注射器を使用するとバトル開始となる。

　戦闘は、Fontaineの体力を０にしてADAMを吸い取る度に第二、第三段階へと続いていくが、基本的に攻撃は直線的なプラスミド弾と突進の２つしかない。体力が0になったFontaineは台座に戻っている。一定時間放置すると回復してしまうので注意。
　Bloodlustを付けている場合、ADAMを吸い取る直前のFontaineに対してレンチを空振りすると、ダメージは通らないが、自分の体力は回復していく。

◇第一段階
プラスミドの属性：炎

• この時点ではまだ完全な一対一。相手が突進をした直後などを狙ってしっかり攻撃を当てていこう。
• Frozen Fieldが有効5~6割の確立で凍結、2~3秒後に凍結解除。(ハードで確認)凍結されたFontaineは攻撃をキャンセルするので　凍結→背後に→凍結解除→殴り→凍結→…　という風にうまく立ち回れば、暴れられることなく倒すことができる。

◇第二段階　
プラスミドの属性：氷

• 第二段階に入るとアラームが鳴り、Security Robotからも攻撃を受けることになる。例によってアラームがなっている間は無限に出てくるので、Botを相手にしているとキリがない。幸いここにも買収装置が設置されているので、金でアラームを止めるか、Security Bullseyeで攻撃の矛先をFontaine本人に向けてしまおう。
• Frozen Fieldは無効(レンチダメージが０に)
• 近接火炎散弾10発前後（ハード）
• Chemical ThrowerのNapalmやElectric Gelも有効。

◇最終段階
プラスミドの属性：雷

• 今度はBotではなくスプライサー達が襲ってくる。Botの時と違い出現を止められないので、この段階になったら威力の高い武器を使ってゴリ押ししてしまうと良い。スプライサーが邪魔なら、Enrageを使ってFontaineをリンチしてもいい。
• グレネード7~8発（ハード）
• 雷属性だがChemical ThrowerのElectric Gelは有効。動きも止められて便利。

　計３回体力ゲージを０にし、ADAMを吸い出すと勝利。健闘を祈ります。

　エンディングはリトルシスターを救出したかどうかによって変化する。