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囲みは、山田先生ページから拝借
=coalescent=
あるDNA断片とあるDNA断片との関係がcoalescentというのは、2本のDNA断片を過去に遡ると、同一のDNAに癒合するという意味
=Wright-Fisherモデル=
繁殖モデルの１つ
有限個体数集団
Diploid集団を扱う
世代のオーバーラップなし
集団個体数は一定(N)
Random matingとHardy-Weinberg平衡
次世代diploid個体の作成
親世代染色体数 2N のプールから２染色体をランダムサンプリングして１個体としそれをＮ回繰り返す(サンプリングされた染色体はプールに戻す)
*finite population size
*discrete generations
*multinomial sampling
*populationは
**randomness due to an evolutionary component
**randomness due to a sampling component
囲みは、山田先生ページから拝借
=カイ二乗=
*独立性の検定の統計量は、
:<math>C_2=\sum_{i,j} \frac{X_{ij}-x_{i.}x_{.j} \div n)^2}{x_{i.}x_{.j} \div n}</math>
*2×2偶現表に限って変形すると、
:<math>c_2=\frac{n(x_{11}x_{22}-x_{12}x_{21})^2}{x_{1.}x_{2.}x_{.1}x_{.2}}</math>
=coalescent=
あるDNA断片とあるDNA断片との関係がcoalescentというのは、2本のDNA断片を過去に遡ると、同一のDNAに癒合するという意味
=Wright-Fisherモデル=
繁殖モデルの１つ
有限個体数集団
Diploid集団を扱う
世代のオーバーラップなし
集団個体数は一定(N)
Random matingとHardy-Weinberg平衡
次世代diploid個体の作成
親世代染色体数 2N のプールから２染色体をランダムサンプリングして１個体としそれをＮ回繰り返す(サンプリングされた染色体はプールに戻す)
*finite population size
*discrete generations
*multinomial sampling
*populationは
**randomness due to an evolutionary component
**randomness due to a sampling component
