define("TEXVC_PATH", "texvc/texvc.cgi");
pukiwiki.ini.phpのPKWKEXP_DISABLE_MULTILINE_PLUGIN_HACKを0にする必要がある場合もあるらしい。僕の場合は大丈夫だった。そんで、
#texvc(){{ P(S_j|S_{j-1})= \begin{cases} \theta^2_j/H^2 & \mbox{if } x_j \neq x_{j-1} \mbox{ and } y_j \neq y_{j-1}\\\\ (1-\theta_j) \theta_j/H+\theta^2_j/H^2&\mbox{if } x_j \neq x_{j-1} \mbox{ or } y_j \neq y_{j-1}\\\\ (1-\theta_j)^2 + (1-\theta_j) \theta_j/H+\theta^2_j/H^2&\mbox{if } x_j =x_{j-1} \mbox{ and } y_j = y_{j-1} \end{cases} }}
という書き方をする。ちなみに改行は\\\\、鉄則。